一、两者产生的原因不同

工程签证贯穿了施工的全过程，所涉及的范围广，这是一项政策性、技术性比较强的工作，在实践中造成工程签证的主要原因包括在施工过程中发生的与设计图纸、施工方案、预算项目或工程质量不相符，要调整工程造价或顺延工期、赔偿损失等形成的书面文件，以便未来出现纠纷时用以解决彼此纷争的依据。而造成工程索赔的主要原因包括:发包人违约;承包人违约;第三人原因导致的索赔;合同缺陷导致的索赔;工程变更导致的索赔;非人为因素导致的索赔等。

二、两者涉及的核心含意表达形式不同

工程签证是承包方与发包方协商一致的成果，系彼此法律行为，其协商的成果可视为建设工程合同重要组成部分，签证一经得到彼此认同，得到的结果对彼此具备约束力。而工程索赔则是合同中的一方自认为自身合法权益受侵害时理当获得的各种费用、顺延工期、赔偿损失没有获得，依法对对方提出应获赔偿的主张。可见，工程索赔系单方面行为，并非双方协商的成果。

三、两者是否依赖直接证据不同

因建设工程具备复杂性、不确定性，工程在施工过程中会出现不同于原设计、原计划的情况，这类变化系对原合同做出的相对应调节，都是情理当中的事，故，双方对于此事变化做出适当调整并进行了书面确认，不需要相对应直接证据作保障。而工程索赔之前提系施工过程工程发生变化造成损害结果，彼此对于此事有分歧，对于此事，要依赖直接证据作保障。

四、两者所涉及的利益是否确认不同

因工程签证是对彼此认可的行为达成共识的成果，故，工程签证所涉及的利益已经基本确认，在工程结算时，对于双方认可的签证，均可直接作为计算工程量及工程价款的依据。而工程索赔如上所述，系单方面的想法和主张，要依赖直接证据作保障，索赔款能否实现取决于司法裁判的认可，是种典型的期待利益，具备不确定性。

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